Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otop3Q80UF9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Otop3Q80UF9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otop3Q80UF9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms