Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lca5Q80ST9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lca5Q80ST9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lca5Q80ST9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms