Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SZRD1Q7Z422 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms