Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rexo1Q7TT28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo1Q7TT28 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rexo1Q7TT28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1916.9 ms