Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2lQ7TS74 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2lQ7TS74 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2lQ7TS74 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms