Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Robo2Q7TPD3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Robo2Q7TPD3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Robo2Q7TPD3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Robo2Q7TPD3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms