Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brd2Q7JJ13 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd2Q7JJ13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd2Q7JJ13 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd2Q7JJ13 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms