Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trappc6aQ78XR0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc6aQ78XR0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc6aQ78XR0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc6aQ78XR0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc6aQ78XR0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc6aQ78XR0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc6aQ78XR0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc6aQ78XR0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc6aQ78XR0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms