Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rph3alQ768S4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rph3alQ768S4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rph3alQ768S4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms