Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP49Q70CQ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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USP49Q70CQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
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USP49Q70CQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP49Q70CQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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USP49Q70CQ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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