Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Syne2Q6ZWQ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Syne2Q6ZWQ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Syne2Q6ZWQ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms