Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX8Q6ZV50 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX8Q6ZV50 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFX8Q6ZV50 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms