Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ncapd3Q6ZQK0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ncapd3Q6ZQK0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms