Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cand1Q6ZQ38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cand1Q6ZQ38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cand1Q6ZQ38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cand1Q6ZQ38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms