Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CASC2Q6XLA1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms