Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NHLRC1Q6VVB1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NHLRC1Q6VVB1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NHLRC1Q6VVB1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC1Q6VVB1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms