Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Casc1Q6TDU8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casc1Q6TDU8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Casc1Q6TDU8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casc1Q6TDU8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms