Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja6Q6S5G4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja6Q6S5G4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja6Q6S5G4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms