Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudcd1Q6PIP5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Nudcd1Q6PIP5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nudcd1Q6PIP5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms