Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx40Q6PE54 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dhx40Q6PE54 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dhx40Q6PE54 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dhx40Q6PE54 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx40Q6PE54 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx40Q6PE54 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx40Q6PE54 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx40Q6PE54 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dhx40Q6PE54 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms