Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhb9Q6PB60 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bhlhb9Q6PB60 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhb9Q6PB60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms