Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W2

Shkbp1, SH3KBP1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shkbp1Q6P7W2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shkbp1Q6P7W2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Shkbp1Q6P7W2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms