Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RbfaQ6P3B9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbfaQ6P3B9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RbfaQ6P3B9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms