Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNCKQ6P2M8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNCKQ6P2M8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms