Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1X6

C8orf82, UPF0598 protein C8orf82, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf82Q6P1X6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8orf82Q6P1X6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf82Q6P1X6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms