Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Slx4Q6P1D7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slx4Q6P1D7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Slx4Q6P1D7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Slx4Q6P1D7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slx4Q6P1D7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms