Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Asic1Q6NXK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asic1Q6NXK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Asic1Q6NXK8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms