Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SWSAP1Q6NVH7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SWSAP1Q6NVH7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SWSAP1Q6NVH7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SWSAP1Q6NVH7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SWSAP1Q6NVH7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SWSAP1Q6NVH7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SWSAP1Q6NVH7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SWSAP1Q6NVH7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms