Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Colgalt2Q6NVG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Colgalt2Q6NVG7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Colgalt2Q6NVG7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt2Q6NVG7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms