Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NipblQ6KCD5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NipblQ6KCD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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