Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg16l2Q6KAU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg16l2Q6KAU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg16l2Q6KAU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg16l2Q6KAU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms