Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN2Q6IMN6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPRIN2Q6IMN6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN2Q6IMN6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.3 ms