Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp7Q6A4J8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp7Q6A4J8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp7Q6A4J8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp7Q6A4J8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.4 ms