Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Swap70Q6A028 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Swap70Q6A028 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Swap70Q6A028 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swap70Q6A028 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms