Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms