Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk13Q69ZA1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cdk13Q69ZA1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cdk13Q69ZA1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cdk13Q69ZA1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms