Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg9aQ68FE2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg9aQ68FE2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg9aQ68FE2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg9aQ68FE2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms