Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Top2bQ64511 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Top2bQ64511 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Top2bQ64511 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Top2bQ64511 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Top2bQ64511 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms