Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim21Q62191 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim21Q62191 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim21Q62191 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms