Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Npm1Q61937 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Npm1Q61937 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Npm1Q61937 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Npm1Q61937 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Npm1Q61937 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm1Q61937 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms