Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcd2Q61285 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcd2Q61285 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms