Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mre11Q61216 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mre11Q61216 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms