Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyb561Q60720 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyb561Q60720 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyb561Q60720 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyb561Q60720 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyb561Q60720 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyb561Q60720 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 494 ms