Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sin3aQ60520 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sin3aQ60520 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sin3aQ60520 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms