Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a4Q5XF90 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a4Q5XF90 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a4Q5XF90 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms