Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a3Q5XF89 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a3Q5XF89 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a3Q5XF89 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms