Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MALRD1Q5VYJ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MALRD1Q5VYJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms