Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLIPQ5VWP3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLIPQ5VWP3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms