Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdcp1Q5U462 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdcp1Q5U462 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms