Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP2Q5T6F2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP2Q5T6F2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms